MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 1408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002679	ATT	2	6	228245	228250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002679	TCT	2	6	233769	233774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_002679	GGC	2	6	233778	233783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_002679	ATT	2	6	233788	233793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_002679	GAG	2	6	233851	233856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002679	CGG	2	6	236660	236665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_002679	CGC	2	6	236667	236672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_002679	TTC	2	6	236695	236700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_002679	GGT	2	6	236724	236729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002679	CGCC	2	8	241297	241304	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1011	NC_002679	TCA	2	6	241347	241352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_002679	GGCCG	2	10	241363	241372	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1013	NC_002679	ATA	2	6	241390	241395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_002679	AGC	2	6	241419	241424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002679	AGG	2	6	241433	241438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002679	GC	3	6	242048	242053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_002679	TGC	2	6	242066	242071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_002679	GAC	2	6	242094	242099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_002679	GCA	2	6	242101	242106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_002679	TCG	2	6	242178	242183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_002679	GC	3	6	242822	242827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_002679	GA	3	6	242828	242833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_002679	AG	3	6	242834	242839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_002679	GCG	2	6	243643	243648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_002679	GAA	2	6	243657	243662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_002679	CCTG	2	8	243706	243713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_002679	CGT	2	6	243728	243733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_002679	TGCT	2	8	243756	243763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_002679	GGGAC	2	10	243777	243786	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_002679	AG	3	6	243803	243808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002679	CA	3	6	245637	245642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_002679	GTT	2	6	245649	245654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002679	CAT	2	6	245690	245695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_002679	GAA	2	6	252462	252467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_002679	A	6	6	253642	253647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_002679	AGT	2	6	259600	259605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_002679	CGA	2	6	259633	259638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_002679	GAA	3	9	260084	260092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_002679	ACC	2	6	260103	260108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_002679	TGA	2	6	260148	260153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_002679	CCCT	2	8	260177	260184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1042	NC_002679	TTG	2	6	262398	262403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002679	CGG	2	6	262488	262493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_002679	CG	3	6	262525	262530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_002679	AGGA	2	8	262538	262545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_002679	TGGC	2	8	262546	262553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_002679	CGA	3	9	262565	262573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_002679	CG	3	6	262734	262739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_002679	AGG	2	6	262802	262807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_002679	GCC	2	6	262810	262815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_002679	CAC	2	6	262842	262847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_002679	CTG	2	6	262852	262857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_002679	CGC	2	6	262902	262907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_002679	GC	3	6	265536	265541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_002679	GATC	2	8	265557	265564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_002679	GCG	2	6	265592	265597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_002679	AAGCG	2	10	265659	265668	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_002679	GCA	2	6	265722	265727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_002679	AAT	2	6	265748	265753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_002679	CGAC	2	8	267001	267008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_002679	TC	3	6	267044	267049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_002679	GCT	2	6	267070	267075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_002679	CATT	2	8	267140	267147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_002679	CG	4	8	267151	267158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_002679	TCTG	2	8	267173	267180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_002679	GTCC	2	8	267600	267607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_002679	TGT	2	6	267680	267685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_002679	TCC	2	6	267743	267748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_002679	CG	3	6	267793	267798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_002679	GCGA	2	8	267799	267806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_002679	CTC	2	6	269471	269476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_002679	GCG	2	6	269519	269524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_002679	TCG	2	6	269531	269536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_002679	GTC	2	6	269857	269862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_002679	ACC	2	6	269885	269890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_002679	ACGCA	2	10	269946	269955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1077	NC_002679	ATG	2	6	269997	270002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_002679	CAG	2	6	270010	270015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_002679	GAA	2	6	270018	270023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_002679	GAC	2	6	270141	270146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_002679	TC	3	6	270207	270212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_002679	CTC	2	6	270269	270274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_002679	TCGG	2	8	270278	270285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_002679	GAC	2	6	270288	270293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_002679	GATG	2	8	270339	270346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_002679	TAC	2	6	270426	270431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_002679	CTC	2	6	271140	271145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_002679	GTCG	2	8	271172	271179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_002679	AGA	2	6	273774	273779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_002679	GGA	2	6	273826	273831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_002679	CAT	2	6	273871	273876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_002679	CTTTC	2	10	274609	274618	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1093	NC_002679	CGAGG	2	10	275105	275114	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1094	NC_002679	GAA	2	6	275357	275362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_002679	ATG	2	6	275376	275381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_002679	AAAAC	2	10	277148	277157	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_002679	CGC	2	6	277158	277163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_002679	CGG	3	9	277176	277184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_002679	GGAA	2	8	277195	277202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_002679	GC	4	8	277207	277214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_002679	TCCT	2	8	279007	279014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_002679	CTT	2	6	279018	279023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_002679	GAC	2	6	279124	279129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_002679	GCG	2	6	279146	279151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_002679	TTC	2	6	279201	279206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_002679	TTTCC	2	10	279213	279222	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1107	NC_002679	CGT	2	6	279242	279247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_002679	CCA	2	6	279455	279460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_002679	CG	3	6	279500	279505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_002679	GCTC	2	8	279602	279609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_002679	CGC	2	6	279658	279663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_002679	CGCGG	2	10	279721	279730	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1113	NC_002679	TGTT	2	8	279767	279774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_002679	GCT	2	6	279794	279799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_002679	GTG	2	6	279862	279867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_002679	GGT	2	6	279901	279906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_002679	TTC	2	6	279913	279918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_002679	CGGG	2	8	279992	279999	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_002679	CCG	2	6	280008	280013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_002679	ATG	2	6	280594	280599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_002679	CGGC	2	8	280601	280608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_002679	GCG	2	6	280612	280617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_002679	GGC	2	6	280687	280692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_002679	GAA	2	6	280835	280840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_002679	GGC	2	6	280901	280906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_002679	TTC	2	6	281024	281029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_002679	CAA	2	6	281038	281043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_002679	GTC	2	6	281111	281116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_002679	G	6	6	281208	281213	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_002679	GCCG	2	8	281225	281232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_002679	CCG	2	6	281249	281254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_002679	CTGG	2	8	281297	281304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_002679	GC	3	6	281357	281362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_002679	GCC	2	6	281401	281406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_002679	CTA	2	6	281445	281450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_002679	TGG	2	6	283143	283148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_002679	AC	3	6	283269	283274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_002679	T	6	6	283275	283280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_002679	CG	3	6	283282	283287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1140	NC_002679	CTG	2	6	283309	283314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_002679	CGG	2	6	312298	312303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1261	NC_002679	CCG	2	6	315349	315354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1262	NC_002679	GGC	2	6	315365	315370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_002679	GC	3	6	315455	315460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1264	NC_002679	CCG	2	6	315463	315468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1265	NC_002679	CGAT	2	8	315535	315542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1266	NC_002679	CGG	2	6	315559	315564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_002679	CGGC	2	8	315679	315686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1268	NC_002679	CCG	2	6	315807	315812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1269	NC_002679	GCGA	2	8	315872	315879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1270	NC_002679	AACG	2	8	315907	315914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1272	NC_002679	GCG	2	6	315955	315960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1406	NC_002679	GAAA	2	8	351618	351625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_002679	CAA	2	6	351681	351686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_002679	GAA	2	6	351894	351899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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